玉皇阁始建于明万历年间（公元1573-1620年），永历丁亥年（公元1647年）因张献忠起义军属部攻破建水城池而被焚毁。永历甲午年（公元1654年）重建。清雍正八年（公元1730年）重修正殿。现存建筑为三进院建筑。崇文塔，始建于元，明代重修。清嘉靖四年（公元1799年）因暴雨倾圮被毁，清道光六年（公元1826年）重修，也称“白马寺”塔。玉皇阁及崇文塔是记录和反映建水宗教历史发展进程中佛、道两教相互融合，塔院相处的重要史证，是建水众多以“文”贯之命名的历史悠久的重要建筑之一。

　　2019年10月7日，建水玉皇阁及崇文塔入选第八批全国重点文物保护单位名单。

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